Acredita-se que a igreja foi construída “de costas” para o centro da cidade por ser uma igreja edificada e frequentada pelos escravos, os quais também eram sepultados em seu adro ou no seu entorno. Embora tenha passado por reformas, ainda conserva algumas características da construção original.
Por muitos anos, a Igreja do Rosário, como é chamada, foi sede também da Irmandade de São Benedito e serviu como Sala dos Milagres do Santuário da Penha e espaço de atendimento do SASP.
Seu Tombamento pelo CONDEPHAAT se deu em 1982.
Desde a comemoração dos seus 200 anos, em junho de 2002, foi retomada a antiga tradição de se festejar Nossa Senhora do Rosário e São Benedito. De lá para cá, a Festa contempla manifestações litúrgicas inculturadas, de religiosidade popular, artísticas e culturais, relacionadas com o passado da Capela, desde os seus primórdios.